元代到明代前期，回回人中包含有信仰伊斯兰教的回纥(回鹘)人的后裔，他们同当时高昌及河西一带仍信仰佛教的畏兀儿人相区别，明中叶以后，维吾尔族普遍接受伊斯兰教信仰，而当维吾尔人迁到内地之后，自然地渐渐同化于回回之中。
元、明以来，不少蒙古贵族及其士卒因接受伊斯兰教信仰而逐渐同化于回回之中。明代哈密地区的哈剌灰人，原是蒙古人，正德(1506～1521)以后由哈密迁到肃州，到万历年间已经“不食猪肉，与回回同俗”。另外，由于通婚的和政治的原因，以及接受宗教信仰和风俗习惯的原因，回回中不断吸收了相当多的汉族成分。由于同样原因也有不少回回逐渐同化于汉族之中。
回族与维吾尔、蒙古、汉等族有着源远流长的亲缘关系。另外，回回族中还吸收有中国犹太人成份。犹太人迁居我国开封等地的时间，一般认为在北宋徽宗年间(1101一1125)。元代称他们为“术忽回回”。由于他们信仰犹太教，不食猪肉，行割礼和每日礼拜等宗教习俗与回回有相似之处，加上举行宗教仪式时所缠头巾为青蓝色，因而也被称为“蓝帽回回”或“青回回”。在长期发展中，有的逐渐融合于回回当中，有的自称回回。
从元代到明代，各种不同的来源的回回逐渐形成为一个新的民族。伴随着民族的形成，具有本民族特点的回回文化扎根于华夏大地，成为华夏文化中的一个新类型。
